其中农业科学（食品科学与工程为主）进入ESI世界排名前1.02‰，临床医学进入ESI世界排名前2.2‰，化学进入ESI世界排名前2.68‰。在全国第四轮学科评估中，食品科学与工程学科评估等级为A，位列全国第3名。学校在2021第三方权威机构学术排名中进入全球前400位。学校设有5所直属附属医院，共有9个国家临床重点专科。学校现设有人文学部、社科学部、理工一部、理工二部和医学部，拥有哲、经、法、教、文、史、理、工、农、医、管、艺等12个学科门类，3个国家重点（培育）学科， 22个博士学位授权一级学科，3个博士专业学位授权类别，11个博士后科研流动站；51个硕士学位授权一级学科，30个硕士专业学位授权类别。南昌大学是国家“双一流”计划世界一流学科建设高校、教育部与江西省部省合建高校、国家“211工程”重点建设高校、江西省高水平大学整体建设高校。学校的化学、临床医学、农业科学（食品科学与工程为主）、工程学、材料科学、药理学与毒理学、生物学与生物化学、分子生物学和遗传学等8个学科进入ESI世界排名前1%。
南昌大学研究生处建于1993年，于2003年成立南昌大学研究生院(筹)；2010年8月研究生院党委更名为南昌大学党委研究生工作部（与研究生院合署办公）。部门机构设置为：综合办公室、招生办公室、培养办公室、学位工作办公室、信息化与评估办公室、研究生思想教育办公室、研究生事务管理办公室等。南昌大学学位委员会挂靠研究生院。研究生院(校党委研工部)是在校党委和校行政领导下负责统筹、协调和管理全校学位与研究生教育工作的行政及党群管理部门。
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