比如有一个穗子很大，籽粒很小，但是另外一个品种籽粒很大，一个籽粒很多，一个籽粒很大，这个杂种它又多又大，这个就是杂种优势。转基因却不同，通过转基因的物种实际已经不再是原来的物种，通过人类对物种的基因排列进行干预，甚至是重组排列，的出来的新的产物，它的外表像原来的的本体，但实质已经改变，比如转基因大豆，外表是大豆，但是它的实质已经不再是大豆，而是人类创造出来的新物种它的基因排列已经不是大豆的基因图谱，它的产量，产油量是大豆的几倍，甚至是几十倍。
在科学家眼睛里，这些大豆不是真正的大豆，它的安全性有待考证，在国外对转基因农作物的争议很大，有科学家认为转基因的作物可能会引起人类或者是其他动物的基因突变，所以是竞争食用和进口转基因农作物的，在发展中国家，为了能解觉人口吃饭问题，所以还是让这些高产的未知物进到人类的嘴里。杂交水稻完全不是转基因。
转基因技术被称为“人类历史上应用最为迅速的重大技术之一”，而袁隆平的杂交水稻被称为中国“第五大发明”。
杂交水稻它是由两个遗传性完全不同的品种，同时优良性状互补。杂交是同一类的物种通过干预混合出来的产物，比如水稻南方的品种有抗病的能力，北方的水稻有抗旱的能力，把两种水稻的花粉混合植入雌蕊，在通过改良培养，就得出南北方混合技能抗病又能抗旱的品种。常常有网友提问，杂交稻是不是转基因？
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