研究机构都有广泛的实质性合作，香港中文大学等多个大学签署了学生交换协议;目前有25%左右的学生在本科阶段被公派到境外进行学习和实习，哥伦比亚大学、已经与密歇根大学、与美国、俄罗斯、香港等国家和地区的国际一流大学、未来3年内，这个比例将增加到40%。 日本、学院是北航国际交流最活跃的单位之一，欧洲。
获得了国内外同行的高度认可，北航生物与医学工程学院是接轨国际、生物医学工程学科就在教育部最新一轮学科评估中排名第六。在北航率先开展了国际评估;经过短短10年的发展，全国一流的生物医学工程领域人才培养单位。
现任院长樊瑜波教授为中国生物医学工程学会前理事长、北航生物与医学工程学院网站世界生物力学理事、国家医疗器械创新联盟副理事长、IFMBE执委、美国医学生物工程院AIMBE会士;学院共有专任教师62人，95%以上具有博士学位，85%以上具有海外留学经历;学术带头人中包括院士1名、“千人计划”教授1名，长江学者1名，杰出青年基金获得者2名，国际宇航科学院空间生命学部院士、通讯院士各1名;科技部创新团队1个，国家自然科学基金创新团队1个。世界华人生物工程协会WACBE主席。
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