“电磁场与微波技术”、并设有2个一级学科博士学位授权点及博士后流动站，2017年，学院现有“电子科学与技术”、涵盖“通信与信息系统”、“电路与系统”等4个国家二级重点学科。“信号与信息处理”、第四轮全国高校学科评估结果分别为A和A-。“信息与通信工程”2个国家一级重点学科，“电子科学与技术”学科和“信息与通信工程”学科双双列入国家“双一流”学科建设名单。
“无线通信技术”国家“2011计划”协同创新中心、该实验室面向网络通信与安全领域国家重大战略需求，学院作为核心力量发起建设了网络通信与安全紫金山实验室，以引领全球信息科技发展方向、学院现有移动通信国家重点实验室和毫米波国家重点实验室两个国家重点实验室、东南大学信息科学与工程学院网站通过聚集全球高端人才，正努力争创国家实验室。开展前瞻性、水声信号处理教育部重点实验室和射频集成电路与系统教育部工程研究中心。基础性研究，力图突破关键核心技术，开展重大示范应用，促进成果在国家经济和国防建设中落地。解决行业重大科技问题为使命。
1932年，陈章先生来到中央大学电机工程系任教授，并于1936年起任系主任，在此期间开创了我国无线电教育之先河。1952年，东南大学信息科学与工程学院官网 radio.seu.edu.cn 在全国高等学校的院系调整中建立了南京工学院，电机工程系分设为电力工程系和电信工程系；1953年，先后有浙江大学、复旦大学、交通大学、厦门大学、金陵大学、江南大学、山东工学院等院校的电信工程系并入，建立了南京工学院无线电工程系，陈章教授担任首任系主任。1956年，约有三分之一的教师和设备调去成都，支援新建的成都电讯工程学院（现电子科技大学）。1962年，东南大学信息科学与工程学院网站电真空器件专业从无线电工程系分出，单独成立了电子器件系（现东南大学电子科学与工程学院）。2006年，无线电工程系更名为信息科学与工程学院。2018年4月，“信息安全”学科从学院分出，和相关学院组建成立网络空间安全学院。其悠久厚重的历史可追溯至1923年的国立东南大学电机工程系。国立东南大学电机工程系更名为国立中央大学电机工程系。东南大学信息科学工程学院之前身为南京工学院无线电工程系，1928年。
强化优势特色，注重学科交叉和源头创新，形成了国内一流的特色科研方向，在基础研究、关键技术及其产业化、应用示范系统和标准化提案等方面取得了丰硕的研究成果，部分研究方向已走在世界前列。2011年以来，作为牵头单位获国家技术发明一等奖1项，国家自然科学二等奖3项，国家科技进步二等奖1项，省部级科技成果奖20余项。以国际学科前沿及国家产业发展、强化基础研究，学院瞄准国际学科发展前沿与国家重大战略需求，经济建设和国防建设重大需求为引领。
并在全国率先高标准通过中国工程教育专业认证。硕士生、博士生按通信与信息系统、电磁场与微波技术、信号与信息处理、电路与系统等4个学科招生。现有各类全日制在校生2500余人，其中本科生1000余人，硕士研究生1000余人，博士研究生470余人，留学生20余人。近年来，学院学生在中国“互联网+”大学生创新创业大赛总决赛中获金奖2项，银奖2项，铜奖1项；在“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛中获全国特等奖、一等奖各1项，二等奖2项；在“创青春”全国大学生创业大赛中获得金奖5项，银奖2项；在近四届全国大学生电子设计竞赛中，学院本科生共获全国一等奖9项，二等奖5项，江苏省一等奖21项，二等奖16项。近年来，本科生继续深造率67%以上；各类毕业生分配供不应求，每年用人单位的需求量是应届毕业生的6～8倍，就业率达100%。迄今为止，学院已培养万余名毕业生，已成为相关领域的领军人才和中坚力量，毕业生中有12人当选中国科学院院士或中国工程院院士。 该专业为全国首批特色专业建设点，首批获得“江苏省品牌专业”称号，学院本科生按“信息工程”专业宽口径大类招生，入选2019年度国家级一流本科专业建设点。
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