积极推进行业内部改革和企业组织结构调整，走向联合，中国烟草行业紧紧围绕“做精做强主业，2004年，累计实现工商税利超过2100亿元，比上年增加450亿元;其中实现工商税金1414亿元，比上年增加225亿元，创历史最好水平。狠抓整顿和规范烟草市场秩序，保持了全行业的平稳发展。加强经济运行调控，推动重组，国家烟草专卖局网站促进了行业各项工作的顺利开展，保持平稳发展”的基本方针和“深化改革，共同发展”的主要任务。
对卷烟制假售假活动始终保持高压态势，全行业坚持“内管外打”方针，一方面强化内部管理，加大整顿规范力度，不断加大打击力度，规范生产经营行为，严防反弹。2004年共查处卷烟制假案件26.9万起，收缴假烟68.7万件，捣毁制假窝点2805个，查获制假烟机1890台，国家烟草专卖局官网 www.tobacco.com.cn 依法拘留制假分子4215人。全行业以财经秩序专项整顿和遏制卷烟体外循环为重点，深入开展整顿规范工作，积极营造公平竞争的市场环境，建立良好的市场秩序。烟草市场秩序取得明显好转。另一方面加强对市场的监管，堵塞管理漏洞，不断强化专卖管理。
成立了16家省级中烟工业公司，稳步推进行业内部改革，行业实行了以省级烟草工商分开为突破口的行业管理体制改革，企业组织结构调整取得积极成果。促进了烟草资源优化整合和生产集中度提高。卷烟工业企业积极实施企业组织结构调整，10万箱以下规模小烟厂已基本关闭，国家烟草专卖局网站10-30万箱卷烟工业企业联合兼并重组整合步伐不断加快。到2004年底，全行业具有独立法人资格的卷烟工业企业减少到57家。在企业联合重组中坚持以名优品牌扩张为支撑，通过实施百牌号战略，明确重点扶持发展牌号，有效促进了产品结构调整和卷烟牌号整合。2004年生产卷烟牌号由原来的1000多个减少到400多个，并培育出了“白沙”、“红梅”、“红河”3个产销量超过百万箱的重点名优品牌。
武汉、全面推进卷烟销售网络建设，全国网建工作先后总结推广南通、烟草商业现代流通水平有了较大提高。成都、上海网建试点先进经验，近两年在“全国网建学上海”的基础上，进一步总结和推广江苏、大连、福建的网建先进经验，加快新业务模式的推广，全面推行客户关系管理，建立公正的货源分配制度，实行明码标价，指导零售户经营，促进了网络功能的发挥和网建整体水平的提高。到2004年底全行业共建立客户服务中心2297个、电话订货中心1281个、配送中心1694个，全国有持证零售客户415万个，传统商业正逐步向“电话订货、网上配货、电子结算、现代物流”的现代流通发展。同时，加快进行取消县级公司法人资格的改革探索，逐步向地市级公司统一经营过渡，积极培育具有活力的市场竞争主体。
在烟叶生产方面，坚持科技进步，“降焦减害”取得新的进展。大力推进技术创新，全行业广泛推广“品种良种化、种植区域化、技术规范化”的“三化”措施，一批先进实用技术得到普及，烟叶质量不断提高，就上中等烟叶比例达到85%。在卷烟生产方面，广泛应用烟草薄片、膨胀烟丝、打叶复烤等新技术、新工艺、新材料，降低能耗，改善卷烟配方结构，提高卷烟产品质量和吸食的安全性。2004年全行业卷烟焦油量降至平均每支13.6毫克。重视和不断加强技术创新体系建设，提高企业的自主创新能力，就全行业有7家国家级企业技术中心和9家行业级企业技术中心。2003年国家局明确提出了发展中式卷烟的战略性课题，制定了《中国卷烟科技发展纲要》，以降焦减害、提高质量、节约资源为主线，积极开展中式卷烟研究工作。行业信息化建设进度加快，全行业卷烟生产经营决策管理系统、公文远程传输系统项目建设进展顺利并投入运行。
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