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“十二五”校级重点学科20个;有2个博士学位授权一级学科,据学校官网2014年9月信息显示,6个硕士专业学位授权点和2个博士后科研工作站。7个硕士学位授权二级学科,10个硕士学位授权一级学科,学校有省级重点(培育)学科9个。

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学校设有25个二级学院(理学院、生命科学学院、药学院、据学校官网2016年8月信息显示,外国语学院、信息电子技术学院、佳木斯大学教务处官网 jwc.jmsu.edu.cn 材料科学与工程学院、机械工程学院、经济管理学院、人文学院、体育学院、美术学院、音乐学院、商学院、建筑工程学院、医学院、基础医学院、留学生教育学院、旅游管理学院、公共卫生学院、检验医学院、佳木斯大学教务处网站护理学院、教育科学学院、警官职业学院、临床医学院(第一附属医院)、口腔医学院(第二附属医院)、康复医学院(第三附属医院)),以及1个国际教育学院和继续教育学院;开设76个本专科专业。

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