物理实验中心等5个教学行政单位，物理系、影像信息工程技术研究中心、学院下设综合办公室、地理信息系统教研室、复杂系统研究中心、以及数学与系统科学研究所、数学系、城市与区域发展研究所等4个研究机构。
秉承“诚毅”校训，努力创建特色学科，积极开展教学研究，取得了丰硕的研究成果。学院始终弘扬嘉庚精神、福建省教学成果奖一等奖一项，集美大学理学院网站精心打造精品课程，“高等数学”和“大学物理”为福建省精品课程，认真贯彻学校办学指导思想，“高等代数”为福建省精品立项课程，“应用数学”为校级重点学科。荣获国家级教学成果奖二等奖一项。
在校本科学生1385人。其办学历史可追溯到1918年爱国华侨陈嘉庚先生创办的集美师范学校，迄今已为国家培养了近万名数学、物理和地理学科的高级专门人才。信息与计算科学、光信息科学与技术以及地理信息系统五个本科专业和一个应用数学硕士点，集美大学理学院现有数学与应用数学、应用物理学。
福建省高校服务海西重点项目、集美大学理学院官网 sci.jmu.edu.cn 福建省高校优秀人才支持计划项目、福建省自然科学基金项目、福建省青年创新基金项目等科研课题80多项，已在《Information Sciences》、《Physical Review Letter》、《Physics Review E》、《Fuzzy Sets and Systems》、《Proc. Amer. Math. Soc.》、《中国科学》、《数学学报》、《物理学报》等国内外近百种学术刊物上发表论文600多篇，其中已被国际权威检索刊物《SCI》、《EI》和《ISTP》收录200多篇，荣获福建省科学技术一等奖1项，各种级别的优秀学术论文奖98篇。集美大学理学院网站学科建设与科研经费达到2000万元。 学院承担了国家973重大项目、国家自然科学基金项目、近年来，中科院创新工程项目。
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