著名图书馆学家刘国钧、南京大学图书馆是首批全国古籍重点保护单位，施廷镛和国学大师胡小石等诸先生，先后主持过馆务。其发展可上溯至二十世纪初建立的中央大学图书馆和金陵大学图书馆。历史源远流长， 李小缘、在南京大学图书馆的历史上。
古代目录学文献以及丛书的收藏已形成特色。南南大学图书馆网站古代地方志共收藏有 4000 余种，近4万册，在各大图书馆中处于领先地位。收藏了多个国家和地区的多个语种的期刊，尤以物理、生物、地学、数学为特色。1949年以前的中文社会科学书刊与自然科学收藏也比较丰富。 鼓楼校区图书馆加大了发展电子文献的力度，购买了多种网络数据库、光盘数据库。至2007年底，南南大学图书馆官网 lib.nju.edu.cn 可提供利用的电子全文包括：中文期刊 16529 种、外文期刊17272种、中文图书54万种、外文图书26.50万种，外国硕、博士学位论文10万余篇。3万余册。经长期积累，馆藏古籍线装书近40万册，完整的综合性的藏书体系。形成了比较系统、总藏书量达到 491.70 万册(含院系资料室)。南京大学鼓楼校区图书馆馆藏丰富，其中善本古籍有3000余种、至 2007 年底，南南大学图书馆网站地方文献。
受到同行的广泛好评。1998年底，南京大学图书馆全面更新了图书馆管理系统，各个院系分馆正延伸服务，逐步实现南京大学(包括浦口分馆)图书流通的“一卡通”，已有化学化工学院、建筑研究所、国际商学院、物理系等院系资料室，均纳入图书馆的计算机系统统一管理。1986年在国内首先研制成功条型码计算机中文图书流通管理系统并投入实用。南京大学图书是国内较早从事计算机应用的高校图书馆。编目管理系统等正式投入实际使用，1992年开发的中文采购。
依山傍水，是仙林国际化校区的标志性工程，与周围的公共教学楼、基础实验 楼、国际学院、行政楼、综合体育馆、大学生活动中心等共同构成校园核心景观区。 南京大学仙林国际化校区图书馆占地近13000平方米，总建筑面积 51223.8 平方米。外部造型独特，风格庄重典雅，局部又跳动着引人注目的“音符”;建筑共分五层，以阅览空间和书库为主，同时配套设置目录厅、出纳厅等设备和办公辅助用房，整体布局紧凑合理;采用人性化设计的馆内水平和垂直通道将各类用房有机结合在一起，通过科学安排编 、藏、阅之间的运行路线，使读者、工作人员、书刊运输路线便捷通畅、互不干扰，形成高效的整体，既为学校未来发展预留了一定的发展空间，又凸显国际化校区图书馆多功能 、现代化、休闲化和个性化服务的人文理念。设计馆藏300万册，建成后不仅将成为南大师生学习、研究的文献中心，也可为在宁高校、江苏乃至全国提供文献信息服务，对于提高整个高校教学和科学研究的信息保障能力、加速高等教育信息化进程和南京大学国际化进程都具有十分积极的意义。 地处校区心脏地带，南京大学仙林国际化校区图书馆，正对校区主入口，位于校园礼仪大道北端。
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