2002年12月，为适应国家新药开发研究和药品注册政策调整的需要，公司创始人共同出资以“东阳市日升昌生物技术有限公司”名义重新进行了注册。公司前身可追溯至于1993年由数位志同道合的公司创始人成立“东阳市吴宁联合生物技术研究所”。浙江孚诺医药股份有限公司是是一家专门从事药品、保健品和化妆品研究与开发的高科技民营实业型企业。2018年12月，经引入私募基金和投资人后正式改制为股份有限公司，孚诺医药用品，更名为“浙江孚诺医药股份有限公司”，现实缴注册资本为5055万元。2004年8月，“东阳市日升昌生物技术有限公司”引入少量股东，经增资扩股后，更名为“浙江日升昌药业有限公司”，注册资本1500万元。
从2013年纳税超千万元开始，截止到2018年年底，孚诺医药，累计上缴税收1.2亿元，为社会和国家带来巨大的经济效益。目前公司“孚诺”复方多粘菌素B软膏从2008年开始的年销量4万支开始，销售量增幅逐年在200%以上。2012年，实现销售收入5000万元，纳税300多万元。
2010年，公司自主研发的的“氢醌”（Hydroquinone）原料药获得药品批准文号-“国药准字H20103706”。2006年，公司自主研发的国内皮肤抗感染药品-“孚诺”复方多粘菌素B软膏（Compound Polymyxin B Ointment）获得上市许可-“国药准字H20061269”，在国内市场销售。2011年，公司制造的“Antifungal Cream”再次在美国上市销售。目前，公司另一重要产品“维氟醌乳膏”已进入临床研究，自2006年完成临床前研究以来，孚诺医药用品，历经十多年不懈努力，终于再次进入临床试验，预计不久也将上市销售。公司领导层主要成员都具重点院校硕士以上学历，在药品研究开发和生产领域从业近三十年，拥有丰富的药品研发和生产管理经验，曾是我国批重组基因工程药物α-干扰素的研究者，并成功地把这一具有自主知识产权的产品推向了市场，于1997年在国内正式上市销售。2009年公司以OEM方式制造的“Triple Antibiotic Ointment”在美国市场上市销售。
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