1999年10月上海交通大学医学院附属仁济医院东院建成投入使用。
尤其是建国五十多年来，建院166年来，技术力量雄厚、上海交通大学医学院附属仁济医院创建于1844年，医院的规模不断扩大，目前已经成为一所学科门类齐全、科研于一体的大型综合性三级甲等医院。新中国成立以来，仁济医院取得了许多临床医学成果，填补了我国医学的多项空白，学科建设和人才培养方面都取得了显著的成效，拥有多个重点学科、重点实验室和临床医学中心。医院现由东西两部组成，西部位于上海市黄浦区中央商务区内，毗邻外滩;东部位于浦东陆家嘴金融贸易区内。医院得到了迅速地发展，上海交通大学医学院附属仁济医院网站教学、是上海第一所西医医院。集医疗。
2008年干部保健综合楼建成并投入使用。
2008年12月仁济医院三期工程新门急诊医技综合楼作为上海市政府重大实事工程破土动工。
肿瘤流行病学研究室、肿瘤所位于斜土路，2010年10月肿瘤所与仁济医院“院所合一”。十一个相关的研究课题组、辅助部门公共服务平台与《肿瘤》杂志编辑部组成。由癌基因与相关基因国家重点实验室。
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