新华书店总店成功申请注册“新华书店”服务商标，牵头筹备成立“中国书刊发行协会”“中国新华书店协会”，使“新华书店”商标及品牌无形资产得到了有效的法律保护和应用，为国家出版发行事业发展做出了新的贡献。
1977年开始，新华书店总店根据中央部署，对经历“文革”冲击的全国新华书店开展恢复整顿工作，在企业管理、业务恢复、队伍培训、发行体制改革、制度建设、创办全国书市(即现在的全国图书博览会)、制定全行业发展规划等方面做了一系列工作，全国新华书店发行网点、事业规模、职工队伍得到蓬勃发展。
2008年4月，总店传统图书批发业务歇业。总店历经多次国家出版物发行体制改革，逐渐失去了出版物总发行总经销的市场优势地位，承担总店图书发行主营业务的新华出版物流通公司资金链和业务链断裂。总店经历了由全国新华书店系统的分散到集中，又由集中到分散的跌宕起伏之路，总店事业也随之进入发展的低谷期。
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