设有山东大学博士、硕士学位授予点，山东第一医科大学硕士学位授予点，一个博士后科研工作站、两个院士工作站，20个国家、省级培训基地，19个国家、省、市级技术指导中心，21个国家、省、市重点学科重点专业重点实验室；是中国医师协会儿科医师分会副会长单位，中国医师协会儿科分会感染、呼吸内镜专业委员会等四个专业委员会主任委员单位。
呼吸内科、神经内科、新生儿科、小儿心血管科已成为省内知名品牌。呼吸介入、微创外、血液肿瘤、神经外、介入医学、脑瘫康复、儿童保健等在全国具有较高知名度。内科设有呼吸、呼吸介入、消化、心血管、神经、肾脏、血液、风湿免疫、内分泌、遗传、新生儿、感染、重症医学等专业；建立了急诊、PICU、NICU、CCU的院内急救体系和覆盖全省的院前转运网络。外科设有骨外、普外、胸外、心外、泌尿外、神经外、新生儿外、整形烧伤外等专业。
在各级政府和社会各界的大力支持和关心下，医院始终把实现好、维护好、发展好人民健康权益，保证儿童身心健康，作为医院改革发展的出发点和落脚点，从质量、安全、服务和儿童健康需求入手，着力构建现代化医院发展的“七个体系”：学科体系、科教体系、管理体系、服务体系、文化体系、信息化体系、保障体系。
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