十二指肠与空肠、结肠均可受累，因全胃肠低动力症，使蠕动缓慢、肠道扩张，肠道憩室，畅内容物淤滞有利于细菌繁殖而导致吸收不良综合征。手的改变最为常见，手指可完全僵硬或变短和变形。3消化系统 多数患者表现为吞咽食物后有发噎感，以及饱餐后随即躺下的“烧心”感、夜间胸骨后痛，均为食管下段功能失调、括约肌受损所致，早期常未引起患者注意。1.肌肉改变 肌肉受累并不少见，发病早期约50%患者可显示肌电图异常，出现肌无力、弥漫性肌肉疼痛，部分病例类似多发性肌炎的临床表现，受累明显者可发生肌肉萎缩。嗄流性食管炎还亓丁引起食管狭窄。
系统性硬化症的症状表现，长期慢性指(趾)缺血，可发生指端骨溶解，指端骨的吸收在X线摄片中可呈截切状表现，其他还可见关节间隙变窄和关节面骨硬化以及骨质疏松。系统性硬化的最常见症状就是肌肉发生改变，出现肌无力或者是弥漫性肌肉疼痛的问题，同时还可能会表现出关节骨畸形的症状，或者是出现胀气，腹痛的明显表现。吞钡透视可见食管蠕动减弱、消失、以至整个食管扩张。3.骨和关节 关节炎性疼痛在早期并非少见，约占12%，在病程中出现关节症状者占46%，轻者表现为轻度关节活动受限，重者关节强直以致挛缩畸形。
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