尽管有巨额资金与牛市作为依托，但不可否认的是股票配资存在的风险不可忽视，从配资公司到配资客户到整个行业都要密切注重风险控制，并且从大趋势上看，配资业务的必要性正在减弱，正规金融业务不断放开，新型金融产品的推出以及监管思路的转化正在挤压着配资的原始空间。
资金池风险。一般的配资公司在配资业务实施之前，会要求客户将保证金转入公司自有账户，此后通过资产管理系统进行子账户拆分，而客户只是在子账户中进行指令操作，实际的买卖与款项都在母账户中，为配资公司在极端条件下挪用资金创造了可能。
波动风险。对股票配资而言，个股的巨量波动特别是下行波动是其经营风险的主要来源。一家接受1:5伞形产品协议的配资公司，其自有资金实际不到20%，极端情况下在重仓股出现三个无量跌停后就可能亏完本金，而极端情况发生的概率目前正随着资金的跑步入场而不断增大。
政策性风险。配资公司往往依靠信托结构化产品放大经营杠杆，信托产品的优先资金则来源于银行。而银行的资金一部分来源于央行的宽松政策，另一部分则来源于房地产的转移。如果配资业务持续爆发，可能会导致房地产泡沫移向股市，所以监管层必然会有杠杆管制措施。
P2P，股票配资业务的几大风险需要注意法律风险。我国境内虽无法律规定机构不得进行“股票配资”业务，但在“法无禁止，便是可行”的前提下，“股票配资”的法律风险不在“配资”本身，机构仍然要注意并积极预防衍生出来的法律风险。比如，因为大部分配资公司的实际交易母账户属于公司账户而非客户账户，如果不法机构利用配资公司风控的弱点，在几家公司同时开立账户对单只股票进行做庄或内幕交易，从现有的实名问责制度来看，责任将全部由配资公司承担。
对于投资者、行业或整个金融体系来说，最不可忽视的就是风险。笔者以为，配资行业快速发展的同时，也蕴含以下四大类主要风险。
粗略统计目前国内有配资公司近万家，从业人员8万人，向证券期货配资的资金超过1000亿元(与P2P网贷规模相当)。机构预计3年内，国内的配资资金将超过3000亿元，从业人员达16万人，配资行业(尤其是股票配资)俨然成为金融市场中一股坚实的力量。现在业内股票配资杠杆比例一般维持在1:3与1:5水平，利息为民间借贷水平，历史年化收益在18%-36%之间，投资者无准入门槛。
火热的股市催生了股票配资业务迅速兴起。配资业务的原理类似于交易所的保证金交易，交易者以自由资金向配资公司融入数倍本金，用该资金进行证券标的买卖，在配资买进股票的过程中就实现了交易杠杆。
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