儿童两病医疗费用补偿实行单病种限额控制，新农合补偿，医疗救助制度救助的综合保障措施。属于救助对象的，新农合制度补偿70%，医疗救助制度救助30%，并承担住院起付费用。属于非救助对象的，新农合制度补偿70%，医疗救助制度救助20%，患儿家庭承担10%，并承担住院起付费用。同时儿童白血病年最高支付限额10.5万元，三类重大疾病年最高支付限额6.5万元。
青海提高农牧区居民重大疾病及儿童医保水平属于非救助对象的，新农合补偿比例在县及县级以上定点医疗机构常规补偿的基础上提高10个百分点，剩余个人自负部分的50%由医疗救助基金救助。
三类重大疾病实行新农合补偿、医疗救助制度救助的综合保障措施。属于救助对象的，新农合补偿比例在县及县级以上定点医疗机构常规补偿的基础上提高10个百分点，剩余个人自负部分，由医疗救助制度救助80%以上，其中五保户剩余个人自负部分100%由医疗救助基金救助；
儿童急性白血病全程住院费用限额控制标准为，急性淋巴细胞白血病，标危组患儿控制在8万元以内，中危组患儿控制在15万元以内。急性早幼粒细胞白血病控制在8万元以内。
先天性动脉导管未闭合并房间隔缺损2.7万元，先天性动脉导管未闭合并肺动脉瓣狭窄2.8万元，先天性房间隔或室间隔缺损合并肺动脉瓣狭窄2.8万元，先天性房间隔缺损合并室间隔缺损2.8万元，先天性冠状动脉心脏瘘2.8万元，先天性房间隔缺损合并部分肺静脉畸形3.1万元，先天性部分型心内膜垫缺损3.1万元，先天性完全型心内膜垫缺损3.7万元，先天性法洛氏四联症4.2万元。
先天性房间隔缺损2.2万元，先天性室间隔缺损患儿2.2万元，先天性动脉导管未闭1.2万元，先天性肺动脉瓣狭窄2.3万元，先天性动脉导管未闭合并房间隔缺损2.7万元，先天性动脉导管未闭合并室间隔缺损2.7万元。
保险，青海提高农牧区居民重大疾病及儿童医保水平儿童先天性心脏病手术治疗全程住院费用限额控制标准
儿童先天性心脏病病种为15种，儿童急性白血病病种为2种。三类重大疾病住院费用按项目付费并补偿，实行起付线、补偿比例、封顶线控制；儿童先天性心脏病手术治疗全程住院费用按单病种限额控制付费，实行起付线、补偿比例、限额标准控制；儿童急性白血病全程住院费用按单病种限额控制付费，实行起付线、补偿比例、封顶线控制。
据了解，纳入保障病种的三大类重大疾病是指参加新农合的农牧民所患重性精神病、乳腺癌、宫颈癌以及其他恶性肿瘤的手术、放疗、化疗，终末期肾病器官移植、透析三类重大疾病；儿童两病病种是指参加新农合的农牧区0—14周岁(包括14周岁)儿童所患先天性心脏病和急性白血病两类疾病。
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