冬小麦腥黑穗病对小麦的产量影响极大，带有病菌的种子会在翌年引起小麦发病，造成小麦减产20-30%，重者小麦减产50%左右。冬小麦腥黑穗病的病症主要出现在穗部，据了解，一般病株较矮，病穗较短且直，开始时为灰绿色，逐渐呈现成灰黄色。防治冬小麦腥黑穗病的高招小麦种植技术，冬小麦腥黑穗病又称为黑麦、黑疸。
防治冬小麦腥黑穗病采取有效的方法，加强小麦的栽培管理，适期播种小麦，促进小麦幼苗能够及早出土，有效的减少小麦的病菌感染；在小麦发病区域进行深耕翻土，并施用腐熟的农家肥；冬小麦的种子必须经过拌种才能播种，在拌种中用2%立克秀拌种剂10-15g，加入少量水调成糊状液体与10kg麦种混匀，晾干后进行播种，也可用种子重量0.15%-0.2%的20%三唑酮、粉锈宁或0.1%-0.15%的15%三唑、醇百坦、羟锈宁、0.2%的40%福美双、0.2%的40%拌种双、0.2%的50%多菌灵、0.2%的70%甲基硫菌灵、甲基托布津、0.2%-0.3%的20%萎锈灵等进行药剂拌种和闷种，都有较好的防治效果。
对于进行连作的麦田进行土壤杀毒，每亩施用70%甲基硫菌灵可湿性粉剂或50%多菌灵可湿性粉剂1-1.5千克，拌细土45-50千克，均匀的洒在小麦的土壤面，之后进行深耕翻土，有效的防治冬小麦腥黑穗病的蔓延和散播。冬小麦腥黑穗病病田的土壤处理。
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