在棚室内使用细菌杀虫剂要注意六个“不要”：
棚室使用杀虫剂“六不要” 不要使用劣质药剂为确保所用药剂质量，应从正规的生产厂家和药剂销售点购买，以防买到假冒伪劣药剂，并要注意药剂的生产日期和使用年限等。
在低温条件下，芽孢在害虫体内繁殖速度慢，蛋白质晶体也不易发生作用。 不要在低温下使用细菌杀虫剂的活性成分是蛋白质晶体和有生命的芽饱。
在有雾的早上喷药或喷药半小时前给蔬菜淋水则效果较好。一般在清晨和傍晚有露水时喷施，以利于菌剂较好地粘在作物茎叶上，并促进芽孢繁殖，提高药效。 不要在干燥环境下使用细菌杀虫剂中细菌的芽孢喜潮湿环境，因此使用时湿度越大药效越高，尤其是喷施粉状生物制剂农药更应注意棚内湿度。
此外，紫外线辐射会使伴孢晶体变形降效。一般在晴天上午10时前或傍晚进行施药。所以，喷施细菌杀虫剂应在阴天或弱光照进菜地时进行。 不要在强光照条件下使用阳光中的紫外线对芽孢有杀伤作用，若光照强烈，紫外线会把细菌杀死。
但如果在施药5小时后喷淋，则不会降低防效，并且还能增效，因为这样有利于细菌芽孢迅速繁殖。棚室使用杀虫剂“六不要”， 不可大水喷淋喷施细菌杀虫剂后不久，不可用大水喷淋，否则会将细菌杀虫剂淋洗掉而降低药效。
因此，即便是喷过杀菌剂的喷雾器也要冲洗干净后才能装配细菌杀虫剂。 不要与杀菌剂混合使用施用细菌杀虫剂时切勿与杀菌剂（多菌灵、甲基托布津等）混用，否则容易导致药剂中细菌数量的严重减少，从而影响杀虫效果。
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