多菌灵农药是人们常用杀菌剂，在给农作物使用杀菌剂时要注意不能随便与其它农药混用。
长期单一使用多菌灵易使病菌产生抗药性，应与其他杀菌剂轮换使用或混合使用。多菌灵可与一般杀菌剂混用，但与杀虫剂、杀螨剂混用时要随混随用，不宜与碱性药剂混用。如土壤处理效果不理想，可改用其他使用方法。安全间隔期15天。作土壤处理时，有时会被土壤微生物分解，降低药效。
由于多菌灵耐高湿，使用时将培养料进行发酵、高温处理，以杀灭霉菌。使用多菌灵农药时应具备的常识，多菌灵对毛霉、根霉的防治效果较差，在使用多菌灵时应适当提高培养料的PH值，以抑制毛霉、根霉的生长。银耳、木耳、猴头菇对多菌灵特别敏感，要避免使用。
多菌灵农药使用时要注意须遵守农药使用防护规程，做好个人防护；为延缓病菌抗药性，应与其他杀菌剂交替使用。
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