病害初期，一般在主茎中下部分杈处一侧出现病斑，褐色腐烂，如果防治不及时就会迅速绕茎一周，植株茎内部也会发生腐烂死棵，严重影响菜农的经济效益。近几年彩椒种植过程中，让菜农们犯愁的就是冬季温度较低时发生的甜椒烂秆死棵现象。
这三种病害可以通过以下症状区分：辣椒疫病在发病初期为水浸状病斑，后出现环绕表皮扩展的褐色或黑褐色条斑，病部以上枝叶逐渐凋萎，田间湿度大时，病部产生白色霉层，有微臭味；菌核病初成水渍状浅褐色斑，后变棕褐色，迅速绕茎一周，然后向上下扩展，湿度大时，病部表面生有白色棉絮状菌丝体，后茎部皮层霉烂，无臭味，干燥后呈灰白色；细菌性软腐病初呈水渍状暗绿色斑，后变褐软腐，具有恶臭气味。甜椒烂秆死棵的原因及防治方法 这种甜椒烂秆死棵现象主要是三种病害引起的：一是疫病，再就是菌核病，还有就是细菌性软腐病。
病害发生前期，只要腐烂没有达到半圈，就可以通过这种办法救活，成功率差不多能达到90%。业内专家表示，防治甜椒烂秆死棵的有效方法，主要就是给植株“动手术”。
病部一定要清理干净，涂抹后的茎部会生出一个瘤状物，但不会影响植株的正常生长。具体的办法就是，用刀片将植株腐烂的部分，然后用坐果灵和甲基托布津、DT等混合溶解成糨糊状，涂抹在掉的部分。
若已经判断出是哪种病害，可以根据病害种类对症施治，这里不再赘述；若不能判断是哪种病害，可以用百菌清或嘧菌酯配合中生菌素或春雷霉素进行防治。在给植株“动手术”的同时，还要全棚喷洒防治这些病害的药剂，杀灭病菌，防止甜椒烂秆死棵的继续传播为害。
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