近年来，研究生院实施了一系列改革措施，促进了研究生创新意识和能力的培养，在提高研究生学术论文的质量和数量，鼓励研究生参与学术访问和学术会议等方面成效显著。北大医学研究生教育以立德树人为根本，始终把思想政治教育放在首位，将研究生德育工作贯穿教育教学全过程，积极构建全员、全过程、全方位育人体系，促进研究生德智体美劳全面发展，不断提高研究生的综合素质。优秀的科研人才和团队不断涌现，一批高水平的研究成果在国际顶尖期刊发表，北大医学已成为科学研究的前沿和知识创新的重要基地。
不忘初心、砥砺奋进，北大医学研究生教育为培养医学领军人才、促进医疗卫生事业发展、实现中华民族的伟大复兴不懈努力。
1984年，经国务院批准，成为首批试办研究生院的22所高校之一。2000年北京大学和原北京医科大学合并后，成为北京大学研究生院医学部分院，全面负责医学部的学位与研究生教育。北京大学研究生院医学部分院（以下简称为研究生院）前身为北京医科大学研究生院。1985年1月25日，北京医科大学研究生院正式成立。
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