开放病床860张，设有37个临床和基础科室，北京同仁医院副教授以上及相应职称者241人。日门、急诊量3500—5000人次,年均住院病人约1.5万人次。全院现有职工2064人。
研究生100余人；北京护校分校1996年至2000年培养中专毕业生278人。近十年共获科研成果奖318项（其中国家级2项、卫生部级9项、北京市级112项）；《内窥镜鼻窦外科的基础与临床研究》、《视网膜移植术》和《糖尿病微血管并发症防治的基础养医疗专业本科生523人，医院科研教学工作成绩显著。
附设北京同仁眼库(国际眼库协会成员)，医院兼有北京市眼科研究所 (世界卫生组织防盲合作中心、北京同仁医院官网（www.trhos.com）博士后流动站)和北京市耳鼻咽喉科研究所(博士后流动站)，设有北京市眼耳鼻咽喉科疾病研究中心和北京市糖尿病防治办公室。
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