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2014年10月，第四期中国超级稻创造了亩产1026.7公斤的实验新纪录。农民们都会将包装上印有“隆平高科”字样的水稻种子默认为“超级水稻”。
2015年4月，在“两优0293”引发的争议声中，农业部发出一则说明，将“两优0293”和超级水稻进行了划分。农业部有关负责人明确表示，安徽省出现减产绝收稻种并非超级稻。
鉴定结论2014年9月23日，两级农委出具鉴定结论，认为绝收或减产属于典型的“穗颈瘟”危害，而孕穗和抽穗期间出现低温连阴雨，品种本身高感稻瘟病，加上适期预防措施不到位，是导致该病暴发的主要原因。
2015年04月14日，隆平高科宣布停售“两优0293”种子。
事件回应公司执行总裁彭光剑解释说，超级稻分为农业部认定和省农业厅认定两种，“两优0293”属于后者，即通过湖南省农业厅认定的超级稻品种。“农业部只是说明‘两优0293’不是农业部认定的超级稻，但省认定的当然有效，他们本来就是两级认证机构，并不冲突。”
袁隆平表示：“两优0293”是10年前育成、2006年通过国家审定的品种，推广这么多年，品种有可能退化，稻瘟病菌的生理小种也有变化，如果生产上不注意，在气候特殊的年份，是可能出问题的，这次在安徽出了点小问题，不能说超级稻都有问题。超级稻百亩片平均亩产达到1026.7公斤，创下了世界纪录。这是科学研究的高峰。大面积推广后，平均亩产能达到七八成，从整体上提高了水稻种植水平。
公司以杂交水稻为核心，以种业为主营业务方向，以农技服务创造价值。公司拥有以袁隆平院士为首的一支专业研发队伍，致力于杂交水稻、杂交辣椒、优质西甜瓜、蔬菜、棉花、玉米、油菜等农作物新品种选育创新。2001年经国家人事部批准，公司设立了博士后科研工作站，年投入科研和成果引进经费3000万元。目前拥有自主知识产权的产品达153个，拥有各项专利97项（次），获奖成果30余项，其中“水稻不育系培矮64S的选育及应用研究”荣获国家科学技术进步一等奖，获国家科技进步二等奖三项。
公司是农业产业化国家重点龙头企业和国家科技创新型星火龙头企业、湖南省重点高新技术企业；公司连续6年被评为优秀高新技术企业和技术创新先进单位，“隆平高科”商标被认定为*商标。
从2000以来主营业务收入平均每年增长48.29%、利润平均每年增长35%，总资产从成立时不到2亿元，发展至2006年的19亿元，总资产4年增长5.8倍，净资产增长10倍多，每股净资产增长5倍。农作物种子年制种面积近50万亩，每年为制种农户增收3亿多元，直接带动农户20多万户，生产的种子推广面积达6000万亩，每年为社会增收40多亿元2004年，据亚洲太平洋种子协会统计，公司成为亚洲较大的种子公司之一。
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