医院对口帮扶含山县人民医院、和县人民医院，托管沙塘街道社区卫生服务中心；管理姑山社区卫生服务中心。2022年4月，市临床检验中心正式调整为医院隶属的二级单位。医院全面托管二级医疗机构博望区人民医院，同时挂牌马鞍山市人民医院博望分院，全面构建市-区紧密型医联体。
马鞍山市人民医院始建于1958年，坐落在风景秀丽的雨山湖畔，是一所集医疗、科研、教学、保健、急救、康复等为一体的三级甲等综合性医院，是本市患者就诊量最大、硬件设备最先进、综合服务能力最强的政府举办的公立医院。
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