深圳市统计局主要职能包括：组织和协调全市统计工作、组织实施本市国民经济核算制度、深圳市统计局官网，组织实施国家统一部署的人口/经济/农业等重大国情国力普查、组织实施全市各行业统计调查等。负责深圳市内政府综合统计的职能部门。
深圳市统计局设有办公室、综合协调处、政策法规处（执法稽查处）、国民经济核算处、工业和能源统计处、投资和建筑业统计处、社会科技和新兴产业统计处、贸易外经统计处、服务业统计处、机关党委（人事处）等内部机构和统计数据管理中心、统计普查中心直属机构。
