应用氨基寡糖素对作物炭疽、疫病、枯黄萎、根腐等病害均可预防并直接控制。尤其重要的是，对病毒病的防治过去往往是植保的难题，而用氨基寡糖素农药防治效果却十分理想。研究表明，氨基寡糖素诱导作物产生多种抗性物质，对由病毒、、等引起的病害的防治都有效。氨基寡糖素有广谱性。
在昆虫刚孵化成幼虫时用氨基寡糖素农药效果好。研究发现，经常使用氨基寡糖素的作物还较少发生虫害。氨基寡糖素对各种蚜虫均有明显的触杀作用，蚜虫触药后4～12小时即死亡。
因此，甲壳素及其衍生物可作粮食、蔬菜作物等种子的处理剂，激发种子提前发芽，促进作物生长，提高抗病能力，从而提高作物产量。氨基寡糖素可作为缓释剂，延长作用时间和减少用药量。
转化成优质的有机肥料，供作物吸收利用，同时可有效的改善土壤团粒结构，有效改良土壤，改善作物的生存环境，是一种多功能的土壤改良剂。氨基寡糖素能增加作物抗性吗？氨基寡糖素的实际应用，氨基寡糖素肥料进入土壤后可以促使有益如固氮菌、纤维分解菌、乳酸菌、放线菌的增生；抑制有害如霉菌、丝状菌的生长。
氨基寡糖素用在果实表面，对病菌的侵害起阻隔作用，而且这层膜有良好的保湿作用和选择性透气作用，因此甲壳素可以成为果蔬保鲜剂的好原料。
氨基寡糖素诱导作物产生的多种抗性物质中，有些具有预防、减轻或修复逆境对植物细胞的伤害的作用，因此施用甲壳素可提高作物的抗寒冷 、抗高温、抗旱涝、抗盐碱、抗肥害、抗气害、抗营养失衡等抗逆性。
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