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2014年学院官网显示，学院有女性文化研究所、西域文化研究所、应用数学研究所、经济管理研究所、计算机应用研究所、西域体育文化研究所、环境科学研究所7个校级研究机构。
2012年度共有科研成果389项，其中，专著3部、参编教材4部、研究报告43份、论文339篇。发表在北大中文核心期刊27篇、CSSCI核心14篇、SCI7篇。2013年度共有科研成果369项，其中，专著3部、参编教材4部、研究报告45份、论文312篇。发表在北大中文核心期刊32篇、CSSCI核心9篇、EI2篇、SCI8篇。
馆藏资源
截至2013年4月，图书馆馆藏印刷型图书664729册、外文原版图书1013册、电子图书94508册。图书馆每年订购纸质中文图书4-5万册，中文期刊600余种。已初步形成了一个以本校重点学科为主，各学科共同发展，网络资源占有一定优势的馆藏体系。
学术期刊
《昌吉学院学报》是昌吉学院主管主办的综合学术理论双月刊，1985年创刊，原名为《西部学坛》、《昌吉师专学报》。1999年，经国家新闻出版总署批准，在全国公开出版发行，2001年更名为《昌吉学院学报》，国内统一刊号是CN 65-1226/G4，国际标准刊号是ISSN 1671-6469。
惟德惟才，笃学笃行
“惟德惟才”即作品格高尚的人，有学识之人。“笃学”就是志于学，专于学，厚于学，在知识与技能上实现厚积厚载。“笃行”就是重于行，实于行，立于行，在思想与实践上实现知行统一。“笃学笃行”是对教育教学方法、学生成长途径的阐释与要求，体现了知行统一的教育思想。
学校校徽以红色为基调，与学院所处地昌吉的昌盛吉祥之意贴合。主图案整体寓意学校是一颗升起的希望之星。下方为学院英文名称及学院维吾尔语名称。
| 院系 | 专业 |
|---|---|
| 中语系 | 汉语言、中国少数民族语言（维吾尔语）、少数民族语言文化（专科） |
| 中文系 | 秘书学（民考汉）、网络与新媒体、秘书学、文秘（专科） |
| 物理系 | 教育技术学、自动化、应用物理学、应用物理学（民考汉）、能源与动力工程、材料物理、电气自动化技术（专科/民考汉）、电气自动化技术（专科） |
| 外语系 | 英语（民考汉）、英语、商务英语 |
| 数学系 | 金融数学、数学教育（专科） |
| 经济管理系 | 公共事业管理（民考汉）、公告事业管理、工商管理（民考汉）、工商管理、财务管理、工商企业管理（专科） |
| 计算机工程系 | 计算机科学与技术（民考汉）、计算机科学与技术、电子商务、计算机应用技术（专科）、电子信息工程技术（专科） |
| 化学工程系 | 应用化学、化学工程与工艺、应用化工技术（专科/民考汉）、应用化工技术（专科）、工业分析与检验（专科/民考汉）、工业分析与检验（专科） |
| 初等教育学院 | 学前教育（专科） |
| 体育系 | 体育教育（民考民）、体育教育、社会体育指导与管理 |
| 音乐系 | 音乐系、音乐表演 |
| 美术系 | 视觉传达设计、美术学、环境设计 |
| 注：注明专科的为专科专业，民考汉、民考民为民族生相关专业 | |
| 分类 | 专业 |
|---|---|
| 本科专业 | 汉语言文学、英语、数学与应用数学、计算机科学与技术、化学、物理学、小学教育（理）、小学教育（文）、学前教育 |
| 专科专业 | 化学教育、英语教育 |
2014年学院官网显示，学院共有教职工590人，其中专任教师441人， 教授、副教授100多人。具有博士、硕士研究生学位的教师近260人；自治区教学名师2个，自治区教学团队1个。
自治区教学团队：电磁学课程建设团队
自治区教学名师：马雪雅、陈惠敏
2013年经教育部批准，学院在“化学工程”和“材料工程”两个领域正式面向全国招收（调剂）全日制专业学位工程硕士研究生。
质量工程
2014年学院官网显示，学院与山东大学、陕西师范大学、吉林大学、厦门大学、北京林业大学、兰州大学、中国石油大学建立了长期对口支援关系，并与山东大学、陕西师范大学联合培养本科生。
| 职务 | 姓名 |
|---|---|
| 昌吉学院党委书记、副院长 | 叶美金 |
| 昌吉学院党委副书记、院长 | 冯武生 |
| 昌吉学院党委副书记、纪检委书记 | 马登杰 |
| 昌吉学院党委副书记、副院长 | 管白楠 |
| 昌吉学院党委委员、副院长 | 姚伶、海拉提·哈布根、邓朝晖 |
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